Marcos Aurélio Barbosa dos Reis cursou as seguintes escolas: Academia Militar das Agulhas Negras, Escola de Artilharia de Costa e Antiaérea, Escola de Aperfeiçoamento de Oficiais, onde foi instrutor, e Escola de Comando e Estado-Maior do Exército.

É Bacharel em Ciências Sociais e Jurídicas, pela Universidade de Caxias do Sul, Especialista em História das Relações Internacionais pela Universidade Estadual do Rio de Janeiro, Mestre em Relações Internacionais pela Universidade Federal Fluminense e Doutor em Estudos Estratégicos Internacionais pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Foi Visiting Researcher do Departamento de Estudos de Defesa do King’s  College, no Reino Unido e atualmente é professor dos Cursos de Graduação e de Pós-Graduação em Relações Internacionais na Unisinos/RGS.